1) تثبیت دمای آب حوضچه‌های کشت جلبک؛ به دلیل نوسانات دمایی زیاد در طول سال و همچنین در طی شبانه روز، حوضچه‌های کشت نیازمند کنترل مداوم و با دقت بالای دمای آب می‌باشد.
2) کاهش هزینه طراحی محیط کشت ریز جلبک‌ها: محیط کشت رشد ریز جلبک‌ها و قیمت بالای طراحی و تهیه آن سبب افزایش هزینه‌های تولید شده است. محیط کشت از چند لحاظ مورد آنالیز و بررسی قرار می‌گیرد از جمله: باکتریایی، آلودگی‌های قارچی و …. عدم آلودگی پس از کشت، هزینه کمتری برای کاشت مجدد تحمیل می‌نماید. فرموله‌سازی مناسب محیط کشت با توجه به آب مورد استفاده برای بهره‌وری بیشتر و کاهش هزینه‌های اولیه کاشت صورت پذیرد.
3) دستگاه‌ها و تجهیزات فراوری ریز جلبک‌ها: عدم وجود دستگاه‌هایی با قیمت و کاربری مناسب جهت فراوری ریز جلبک‌ها، مانند دستگاه استخراج ماده موثره‌ی محصول.